Những tháng đầu năm 2013, với người dân ở Phú Yên, thách thức lớn vẫn là dịch bệnh trên tôm. Bởi tình hình dịch bệnh tôm nuôi vẫn còn khá nan giải, nếu không làm tốt ngay từ khâu con giống đầu vào, đến việc vệ sinh ao nuôi theo quy trình công nghệ tiên tiến…, rất nhiều khả năng dịch bệnh bùng phát trở lại. Chưa kể, nhiều dịch bệnh mới có thể phát sinh, khó kiểm soát. . Ước tính giá trị thiệt hại do dịch bệnh trên tôm trong năm qua lên tới hàng tỷ đồng làm thiệt hại lớn về kinh tế cho nông dân.
Được biết, trong năm 2012, Phú Yên có hơn 2.100ha tôm thẻ và tôm sú, trong đó trên 900ha ở các huyện Tuy An (193ha), Đông Hòa (638,5ha) và TX Sông Cầu (71,6ha) bị bệnh phải thu hoạch sớm, mất trắng gần 66ha; ngư dân thả nuôi 24.373 lồng tôm hùm, dịch bệnh làm chết gần 534.000 con, chủ yếu là thương thẩm. Tôm chết nhiều nhất là ở TX Sông Cầu với 350.000 con, đẩy hàng trăm hộ nuôi lâm vào cảnh lao đao, thua lỗ nặng, nhiều hộ mất khả năng chi trả vốn vay ngân hàng và tái đầu tư./.