Hiện ngành nông nghiệp đang chú trọng phát triển các mô hình nuôi theo tiêu chuẩn an toàn vệ sinh thực phẩm nhằm đáp ứng nhu cầu thị trường và nâng cao giá trị sản phẩm hàng hóa thủy sản. Đến nay, thành phố đã mở rộng diện tích nuôi thủy sản theo tiêu chuẩn lên 84,48ha. Bao gồm: cá tra 82,23ha (17,5ha GlobalGAP, 10ha BAP, 10ha ASC, 15ha BMP, 29,73ha VietGAP) và cá khác 2,25ha (cá lóc 1,25ha VietGAP, lươn 0,34ha VietGAP, cá rô phi 0,66ha ASC).