Tăng cường phối hợp tìm kiếm cứu nạn trên biển là một trong những nội dung quan trọng trong quy chế phối hợp hoạt động do Bộ Tư lệnh Cảnh sát biển và Tổng Cục Thủy sản vừa ký kết. Bên cạnh đó, các nội dung phối hợp hoạt động gồm trong chỉ đạo, kiểm tra, giám sát; cung cấp, trao đổi tình hình, thông tin tài liệu; xây dựng, tổ chức thực hiện các văn bản quy phạm pháp luật; công tác đảm bảo an toàn hàng hải, an ninh hàng hải, phòng ngừa ô nhiễm môi trường biển và hợp tác quốc tế; phát hiện, ngăn chặn, điều tra xử lý vi phạm; tuyên truyền phổ biến pháp luật và phối hợp trong công tác xây dựng lực lượng.
Trong quá trình hoạt động, hai lực lượng sẽ có những kế hoạch cụ thể để từng bước góp phần thực hiện tốt chức năng quản lý Nhà nước, bảo vệ chủ quyền biển, đảo và duy trì trật tự, an toàn, an ninh trong vùng biển Việt Nam.