EC cho phép sử dụng protein chế biến từ động vật nuôi không thuộc các loài nhai lại, chủ yếu là lợn và gia cầm trong thức ăn nuôi thủy sản.
EU đã cấm sử dụng protein chế biến từ gia súc vào năm 1997 và từ tất cả các loài động vật vào năm 2011 nhằm loại trừ nguy cơ nhiễm bệnh bò điên (BSE). Sau lệnh cấm, thủy sản được nuôi bằng thức ăn chế biến từ loài cá khác với chi phí đắt hơn.
Theo EC, số liệu mới nhất cho thấy EU đã gần loại bỏ được bệnh bò điên trong đàn gia súc, còn giới khoa học cũng cho rằng nguy cơ lây lan bệnh này giữa các các loài động vật không thuộc loài nhai lại là không đáng kể. EC sẽ sử dụng thử nghiệm protein chế biến từ lợn trong thức ăn nuôi gà và protein chế biến từ gà trong thức ăn nuôi lợn.