Hiện nay, huyện Hoằng Hóa đang phát triển gần 3.000 ha nuôi trồng thủy sản, trong đó hơn 1.700 ha nước mặn và lợ, hơn 100 ha nuôi tôm thẻ chân trắng thâm canh, còn lại là các vùng nuôi nước ngọt và các mô hình cá – lúa. Những năm gần đây, sản lượng thủy sản nuôi trồng của huyện đều đạt trên dưới 6.200 tấn/năm. Huyện đã hình thành được các vùng nuôi, như tôm công nghiệp ở các xã Hoằng Phụ, Hoằng Yến; nuôi tôm sú, các loại cá và cua theo hình thức quảng canh cải tiến và bán thâm canh ở các xã: Hoằng Châu, Hoằng Phong, Hoằng Lưu; nuôi ngao tại xã Hoằng Trường...
Riêng trong nuôi trồng thủy sản nước lợ, Hoằng Hóa đã chiếm hơn 50% diện tích toàn tỉnh, tập trung ở các xã vùng cửa sông Mã và khu vực Cồn Trường phía Đông Nam của huyện.