Bến Tre có nhiều tiềm năng, thế mạnh phát triển ngành thủy sản, cả về khai thác lẫn nuôi trồng. Hiện nay, tỉnh xác định liên kết sản xuất theo chuỗi giá trị và ứng dụng công nghệ cao vào sản xuất là 2 trong nhiều giải pháp để phát triển lĩnh vực này theo hướng sản xuất hàng hóa, đáp ứng yêu cầu ngày càng cao của thị trường trong, ngoài nước và thích ứng với biến đổi khí hậu.
Những năm gần đây, sản lượng thủy sản nuôi trồng và khai thác của tỉnh Bến Tre tăng lên đáng kể, tạo ra nguồn nguyên liệu dồi dào cho tiêu dùng trong nước và chế biến xuất khẩu. Năm 2016, tổng giá trị sản xuất ngành thủy sản đạt gần 16.900 tỷ đồng, chiếm 46,5 % giá trị sản xuất của khu vực nông – lâm – thủy sản; góp phần quan trọng trong tăng trưởng kinh tế chung của tỉnh, làm thay đổi đáng kể diện mạo nông thôn và nâng cao đời sống nông dân.
Tỉnh Bến Tre hiện có 46.800 ha nuôi thủy sản, sản lượng hằng năm đạt 248.000 tấn. Các đối tượng nuôi chính như: tôm biển, nghêu, cá tra, hàu, sò huyết, tôm càng xanh và một số đối tượng khác như: cá điêu hồng, cá chim trắng, cá rô phi, cá chẽm… với các hình thức nuôi thâm canh, bán thâm canh, luân vụ, nuôi xen, nuôi lồng bè. Có thể nói, nhờ điều kiện tự nhiên đa dạng, nên hoạt động nuôi thủy sản phát triển khá phong phú, từ đối tượng nuôi đến hình thức nuôi gắn với từng vùng sinh thái.
Một trong những ưu điểm nổi bật của nghề nuôi thủy sản Bến Tre hiện nay là, dù nuôi nước lợ hay ngọt thì các hộ nuôi và doanh nghiệp ngày càng mạnh dạn áp dụng tiến bộ khoa học kỹ thuật, áp dụng thực hành nông nghiệp tốt vào sản xuất, đạt chứng nhận GlobalGap, ASC, MSC, BAP, AquaGap… để xuất khẩu vào các thị trường có yêu cầu cao.
Để tăng sức cạnh tranh trong quá trình hội nhập kinh tế thế giới, ngành nông nghiệp Bến Tre đã từng bước xây dựng và hướng nghề nuôi thủy sản phát triển có trọng tâm, trọng điểm để tăng năng suất, chất lượng trong điều kiện thích ứng với biến đổi khí hậu. Từ đầu năm 2016, Tỉnh ủy Bến Tre đã ban hành Nghị quyết số 03 “Xây dựng và hoàn thiện chuỗi giá trị sản phẩm nông nghiệp chủ lực tỉnh Bến Tre giai đoạn 2016 – 2020 và định hướng đến năm 2025. Theo đó, tôm biển là 1 trong 8 đối tượng được chọn để xây dựng chuỗi giá trị.
Song song với hoạt động nuôi trồng, nghề khai thác thủy sản ở Bến Tre cũng ngày càng phát triển cả về số lượng và chất lượng, nhất là đầu tư, trang bị hiện đại, đủ điều kiện để khai thác xa bờ và bám biển dài ngày hơn. Đến nay, đội tàu của tỉnh có hơn 3.900 chiếc, tổng công suất hơn 1.000.000 mã lực. Trong đó, đội tàu khai thác xa bờ của tỉnh hơn 2.000 chiếc, công suất bình quân 575 mã lực/ chiếc. Nguồn lợi thủy sản khai thác đạt hơn 200.000 tấn/năm, chiếm khoảng 44,6% trong tổng sản lượng thủy sản.
Tỉnh Bến Tre hiện có 11 nhà máy hoạt động chế biến thủy sản phục vụ xuất khẩu, sản phẩm chủ yếu là thủy sản đông lạnh, chả cá, công suất đạt 72.000 tấn sản phẩm/năm; trong đó sản phẩm cá tra Fillet, nghêu chiếm tỷ trọng lớn nhất. Với nguồn nguyên liệu dồi dào, hiện nay, Bến Tre đang kêu gọi thu hút đầu tư vào lĩnh vực chế biến thủy sản, nhất là chế biến tôm biển.
Giai đoạn 2016- 2020, tỉnh Bến Tre xác định kinh tế thủy sản tiếp tục là 1 trong 2 thế mạnh của tỉnh. Trong đó, chọn nuôi trồng là mũi đột phá để tạo giá trị tăng thêm của ngành và tập trung mọi nguồn lực để đầu tư khai thác có hiệu quả. Thực hiện đồng bộ các giải pháp sẽ giúp ngành nông nghiệp hoàn thành mục tiêu phát triển thủy sản theo hướng bền vững, thành một ngành sản xuất hàng hóa lớn, có cơ cấu và tổ chức sản xuất hợp lý, năng suất, chất lượng, hiệu quả cạnh tranh cao.