Có khoảng 90% tổng số lồng bè hàu nuôi tại xã Phổ Thạnh bị chết với tỷ lệ từ 40 - 90%, trong đó có những lồng nuôi hàu chết sạch, thiệt hại nhiều tỷ đồng. Trước đó, cuối tháng 9/2016, cũng tại khu vực này hàng nghìn con cá bớp nuôi lồng của người dân cũng bị chết, trọng lượng cá từ 2 - 4kg/con.
Hiện có khoảng 70 hộ tham gia nuôi thủy sản tại khu vực biển ở cảng neo đậu tàu Sa Huỳnh. Diện tích mặt nước không lớn nhưng số hộ tham gia nuôi nhiều, trong khi nguồn nước ở khu vực này bị ô nhiễm từ chất thải của tàu thuyền neo đậu, các cơ sở chế biến hải sản, đóng tàu... Bất chấp sự khuyến cáo của chính quyền và ngành chức năng, việc nuôi trồng thủy sản ngoài vùng quy hoạch vẫn diễn ra phổ biến ở Quảng Ngãi.