Đề án bồi thường thiệt hại được Bộ NN&PTNT dự kiến với mức kinh phí là 12.100 tỷ đồng, cụ thể: Kinh phí bồi thường thiệt hại 6.500 tỷ đồng; kinh phí xây dựng hệ thống quan trắc, giám sát và cảnh báo môi trường biển 500 tỷ đồng; phục hồi, tái tạo nguồn lợi thủy sản, thảm cỏ biển 920 tỷ đồng; kinh phí thành lập Quỹ Tái tạo nguồn lợi thủy sản cấp tỉnh 300 tỷ đồng. Toàn bộ kinh phí bồi thường của Công ty TNHH Gang thép Hưng Nghiệp Formosa sẽ được giải ngân và quyết toán kết thúc trước ngày 31-12-2019.