Theo đó, các mẫu chứng thư mới này sẽ được áp dụng từ ngày 26/11/2012 và có một khoảng thời gian chuyển tiếp đến ngày 1/3/2013. Để tránh vướng mắc trong việc xuất khẩu thủy sản sang EU, Cục Quản lý chất lượng nông lâm sản và thủy sản đã có văn bản yêu cầu các doanh nghiệp chế biến xuất khẩu thủy sản vào EU nghiên cứu kỹ Quy định 1012/2012 và chủ động liên hệ với nhà nhập khẩu EU để tránh vướng mắc phát sinh khi xuất khẩu thủy sản vào EU.
Ngoài ra, để đảm bảo các lô hàng thủy sản xuất khẩu vào EU từ ngày 1/3/2013 được cấp chứng thư theo mẫu mới, cục cũng đã yêu cầu các trung tâm chất lượng nông lâm thủy sản vùng thống nhất thực hiện việc kiểm tra, cấp chứng thư theo mẫu mới cho các lô hàng thủy sản xuất khẩu sang EU dùng làm thực phẩm bắt đầu từ ngày 1/1/2013.