Chính sách thuế GTGT đối với phế liệu, phế phẩm trong chế biến thủy sản

Cục Thuế đã có Văn bản số 3913/CT-CS trả lời kiến nghị của Hiệp hội Chế biến và Xuất khẩu thủy sản Việt Nam (VASEP) liên quan đến chính sách thuế GTGT đối với phế liệu, phế phẩm trong chế biến thủy sản.

Trước đó, VASEP (thông qua Bộ Tư pháp) phản ánh nội dung kiến nghị liên quan đến khoản 1 Điều 4 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013, khoản 5 Điều 5 Thông tư số 219/2013/TT-BTC, Điều 11 Thông tư số 219/2013/TT-BTC và Mục b.1 Khoản 3 Điều Thông tr 83/2014/TT-BTC ngày 26/6/2014.

Cụ thể, một số doanh nghiệp chế biến thủy hải sản vừa có sản phẩm đông lạnh chưa qua gia nhiệt, vừa có sản phẩm đông lạnh đã qua hấp, luộc chín.

Dù nguyên liệu đầu vào giống nhau, nhưng theo hướng dẫn của cơ quan thuế địa phương, thuế suất GTGT áp dụng khi xuất bán phế liệu, phế phẩm của hai loại sản phẩm lại khác nhau.

Đối với phế liệu, phế phẩm, phụ phẩm từ thủy hải sản chưa qua chế biến hoặc chỉ qua sơ chế, bảo quản thông thường, doanh nghiệp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT theo Khoản 5 Điều 5 Thông tư số 219/2013/TT-BTC.

Đối với phế liệu, phế phẩm, phụ phẩm từ thủy hải sản đã qua chế biến (như luộc chín), doanh nghiệp phải áp dụng mức thuế suất GTGT phổ thông 10% theo Điều 11 Thông tư 219/2013/TT-BTC.

Về nội dung này, Cục Thuế dẫn quy định mới tại khoản 1 Điều 5 Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 (có hiệu lực từ 1/7/2025), khoản 1 Điều 4 Nghị định số 181/2025/NĐ-CP và điểm a khoản 2 Điều 10 Thông tư số 69/2025/TT-BTC.

Theo đó, sản phẩm thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường của tổ chức, cá nhân tự sản xuất, đánh bắt bán ra và ở khâu nhập khẩu thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

Các hình thức sơ chế thông thường được quy định rõ như: làm sạch, phơi, sấy khô, bóc vỏ, xay xát, cắt, lột da, ướp muối, bảo quản lạnh (ướp lạnh, đông lạnh), bảo quản bằng khí, hóa chất thông dụng để tránh hư hỏng...

Trường hợp không xác định được mức độ sơ chế, Bộ Nông nghiệp và Môi trường sẽ căn cứ quy trình sản xuất để xác định.

Đối với phế phẩm, phụ phẩm, phế liệu được thu hồi để tái chế, sử dụng lại, khi bán ra sẽ áp dụng mức thuế suất theo thuế suất của chính mặt hàng phế phẩm, phụ phẩm, phế liệu đó.

Cục Thuế nhấn mạnh, từ ngày 1/7/2025, pháp luật thuế GTGT đã có quy định chi tiết, rõ ràng về sản phẩm thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến hoặc chỉ qua sơ chế thông thường, cũng như về thuế suất áp dụng cho phế phẩm, phụ phẩm. Theo đó, Thông tư số 219/2013/TT-BTC đã hết hiệu lực thi hành.

Cục Thuế đề nghị VASEP nghiên cứu, thực hiện đúng theo quy định mới của Luật Thuế GTGT 2024, Nghị định 181/2025/NĐ-CP và Thông tư 69/2025/TT-BTC.