Đối với vi phạm quy định về Hạn ngạch sản lượng khai thác thủy sản, phạt tiền từ 20-50 triệu đồng đối với hành vi khai thác thủy sản vượt từ 10% trở lên hạn ngạch sản lượng cho phép khai thác. Nghị định 42/2019/NĐ-CPđã nêu hai hình thức xử phạt bổ sung: (1) Tịch thu thủy sản khai thác vượt quá hạn ngạch sản lượng cho phép khai thác đối với hành vi vi phạm quy định; (2) Tước quyền sử dụng Giấy phép khai thác thủy sản từ 6-12 tháng đối với hành vi khai thác thủy sản vượt từ 30% trở lên hạn ngạch sản lượng cho phép khai thác.
Đối với vi phạm quy định về Giấy phép khai thác thủy sản, phạt tiền từ 20-50 triệu đồng đối với một trong các hành vi vi phạm sau: Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 06 mét đến dưới 12 mét khai thác thủy sản trong vùng biển Việt Nam không có Giấy phép khai thác thủy sản hoặc Giấy phép khai thác thủy sản đã hết hạn; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất dưới 15 mét khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 12 mét đến dưới 15 mét khai thác thủy sản trong vùng biển Việt Nam không có Giấy phép khai thác thủy sản hoặc Giấy phép khai thác thủy sản đã hết hạn; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 15 mét trở lên khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản.
Đặc biệt là phạt tiền từ 50-70 triệu đồng đối với các trường hợp tái phạm sau: Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 12 mét đến dưới 15 mét khai thác thủy sản trong vùng biển Việt Nam không có Giấy phép khai thác thủy sản hoặc Giấy phép khai thác thủy sản đã hết hạn trong trường hợp tái phạm; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 15 mét trở lên khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản trong trường hợp tái phạm.
Hình thức xử phạt bổ sung trong tất cả các trường hợp vi phạm quy định về Giấy phép khai thác thủy sản là: Tịch thu thủy sản khai thác.
Bên cạnh đó, còn áp dụng hình thức tịch thu ngư cụ đối với một trong những hành vi sau: Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất dưới 15 mét khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 12 mét đến dưới 15 mét khai thác thủy sản trong vùng biển Việt Nam không có Giấy phép khai thác thủy sản hoặc Giấy phép khai thác thủy sản đã hết hạn; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 15 mét trở lên khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản; Tái phạm các hành vi vi phạm.
Ngoài ra, sẽ tước quyền sử dụng văn bằng, chứng chỉ thuyền trưởng tàu cá từ 6-12 tháng đối với các hành vi: Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 12 mét đến dưới 15 mét khai thác thủy sản trong vùng biển Việt Nam không có Giấy phép khai thác thủy sản hoặc Giấy phép khai thác thủy sản đã hết hạn; Sử dụng tàu cá có chiều dài lớn nhất từ 15 mét trở lên khai thác thủy sản không đúng nghề ghi trong Giấy phép khai thác thủy sản; Tái phạm các hành vi vi phạm.
Nghị định 42/2019/NĐ-CP có hiệu lực thi hành từ ngày 05 tháng 7 năm 2019.