Theo đó, năm 2016 Quỹ triển khai 4 chương trình hỗ trợ DNNVV với tổng hạn mức 560 tỉ đồng, bao gồm các lĩnh vực: đổi mới sáng tạo; sản xuất, chế biến và bảo quản nông, lâm và thủy sản; sản xuất sản phẩm công nghiệp phụ trợ cho ngành điện tử và cơ khí; quản lý và xử lý rác thải, nước thải. Thời hạn triển khai đến hết năm 2016. Thời hạn Quỹ nhận hồ sơ từ ngân hàng nhận ủy thác đợt 1 từ 15/7 đến 30/7/2016.
Chương trình hỗ trợ DNNVV tham gia vào chuỗi sản xuất, chế biến và bảo quản nông, lâm và thủy sản có hạn mức 210 tỉ đồng. Doanh nghiệp có hồ sơ được xét duyệt sẽ được vay tối đa 20 tỉ đồng, thời gian ân hạn trả nợ gốc tối đa 18 tháng.
Ngoài các tiêu chí về đối tượng ưu tiên hỗ trợ của quỹ, doanh nghiệp nộp hồ sơ xét vay còn phải đáp ứng một số tiêu chí riêng của từng chương trình mà doanh nghiệp đăng ký tham gia.
Các chương trình hỗ trợ có các chính sách ưu đãi chung cho doanh nghiệp, gồm: thời hạn vay 7 năm, lãi suất cố định trong suốt thời hạn vay vốn là 7%/năm; ngân hàng nhận ủy thác không được yêu cầu tài sản đảm bảo vượt quá 100% giá trị khoản vay và DNNVV có thể sử dụng tài sản hình thành từ vốn vay làm tài sản đảm bảo cho khoản vay; phương thức trả nợ đa dạng, phù hợp với dòng tiền của doanh nghiệp; DNNVV được chủ động trả nợ trước hạn và được miễn phí trả nợ trước hạn…
Ba ngân hàng gồm: Vietcombank, BIDV và HDBank được triển khai hoạt động ủy thác từ quỹ này để giải ngân nguồn vốn cho các DNNVV thuộc các ngành nghề: nông nghiệp, lâm nghiệp và thủy sản; công nghiệp chế biến, chế tạo; cung cấp nước; hoạt động quản lý và xử lý rác thải, nước thải; đầu tư dự án phục vụ sản xuất kinh doanh.