Một số người dân địa phương cho rằng một số vực sâu có vai trò quan trọng đối với việc cư trú của các loài cá trong mùa khô. Kết quả khảo sát nghiên cứu cho thấy có 100 loài cá ở 5 vực sâu, trong đó có 24 loài được xác định là cư trú thường xuyên ở vực sâu trong mùa khô. Đa dạng loài càng cao khi diện tích vực sâu càng lớn và nền đáy càng gồ ghề. Cá có kích thước càng lớn khi độ sâu càng cao. Vực sâu Vàm Nao có sản lượng khai thác cao nhất, có nhiều loài cá có kích thước lớn giá trị kinh tế cao, và một số loài cá đang có nguy cơ bị đe dọa như cá hô và cá vồ đém. Vì thế, vực sâu này cần thành lập khu bảo vệ/bảo tồn để có thể bảo vệ tốt hơn nguồn lợi thủy sản mà hiện nay ngày càng suy giảm.