Các hộ thả nuôi tôm thẻ chân trắng đang đối mặt với tình trạng tôm nuôi bị chết trên diện rộng, hiện có 110 ha bị thiệt hại với lượng giống hơn 62 triệu con, chiếm hơn 29% lượng giống thả nuôi.
Tôm nuôi bị chết đa phần do nhiễm bệnh đốm trắng. Đây là loại bệnh không có thuốc đặc trị. Tôm chết thường ở giai đoạn 25-40 ngày tuổi, gây thiệt hại nặng người nuôi.
Điều đáng lo ngại là do vụ nuôi tôm sú chính vụ năm 2012 đa phần các hộ nuôi bị thất bại do tôm nhiễm bệnh hội chứng hoại tử gan tụy, hoại tử dưới vỏ và cơ quan tạo máu (IHHNV).
Đây là loại bệnh mới xuất hiện, các nhà quản lý và chuyên môn đều tỏ ra lúng túng, chưa có biện pháp phòng trị hữu hiệu. Trong khi đó, có một số hộ chuyển sang nuôi lấp vụ (vụ 2) tôm thẻ chân trắng trên diện tích nuôi tôm sú bị thiệt hại lại thu được lãi. Từ đó, một số địa phương có chủ trương chuyển sang nuôi tôm thẻ chân trắng trên diện tích nuôi tôm sú trước đây trong vụ nuôi năm 2013. Chỉ tính riêng huyện Cầu Ngang, có kế hoạch mở rộng diện tích nuôi tôm thẻ chân trắng lên 2.000 ha với lượng giống thả nuôi khoảng 60 triệu con trong năm 2013.