Để hạn chế tác động bất lợi và phát triển bền vững nghề nuôi tôm hùm, nuôi ngao/nghêu, Tổng cục Thủy sản đã có Công văn số 516/TCTS-NTTS và Công văn số 541/TCTS-NTTS hướng dẫn và chỉ đạo các tỉnh có nuôi ngao và nuôi tôm hùm lồng tăng cường quản lý nuôi ngao và tôm hùm tại địa phương. Trong đó, nhấn mạnh việc quản lý nuôi ngao và tôm hùm theo đúng quy hoạch đã được phê duyệt, đồng thời triển khai nhiều biện pháp kỹ thuật nhằm ứng phó với điều kiện môi trường bất lợi, quản lý tốt vùng và lồng nuôi hạn chế sự phát sinh và lây lan dịch bệnh; hướng dẫn thực hiện khai báo và thực hiện các biện pháp cần thiết khi thủy sản nuôi có dấu hiệu bị bệnh/chết bất thường. Đồng thời yêu cầu địa phương, người nuôi thủy sản chủ động phối hợp với các đơn vị chức năng, cơ quan nghiên cứu thực hiện thu mẫu quan trắc môi trường, giám sát dịch bệnh, điều tra, xác định mức độ dinh dưỡng; sức tải của môi trường, sự ô nhiễm vùng nuôi để đưa ra cảnh báo, khuyến cáo kịp thời cho người nuôi.