Việt Nam: Chủng vi khuẩn Vibrio harveyi là nguyên nhân gây EMS

Một chủng vi khuẩn Vibrio (KC13.17.5) gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (AHPND) trên tôm nuôi ở miền Bắc Việt Nam đã bị cô lập. Thông thường, AHPND được gây ra bởi vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus, nhưng trình tự bộ gen chỉ ra rằng đó là do chủng Vibrio harveyi. Dữ liệu trình tự giống như trình tự plasmid và gen độc lực giả định.

xác định bệnh trên tôm
Ảnh minh họa: tepbac.com

Nuôi tôm mang lại giá trị kinh tế cao. Sản lượng tôm gia tăng đều đặn cho đến năm 2011, trước khi có sự bùng nổ của một loại bệnh mới được gọi là hội chứng chết sớm (EMS) hay bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (AHPND), gây thiệt hại nghiêm trọng cho ngành công nghiệp. Tỷ lệ chết bởi AHPND lên đến 100% và các tác nhân gây AHPND là một chủng vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus. Trình tự bộ gen của các chủng từ Thái Lan và Mexico có một đoạn plasmid có thể chứa các gen độc lực giả định. Chủng độc lực cao có thể được xác định bằng phương pháp PCR sử dụng cặp mồi dựa trên các gen độc lực.

Bởi vì các gen độc lực nằm trên một plasmid, độc lực có thể được truyền không chỉ giữa các chủng V. parahaemolyticus mà còn đối với các loài vi khuẩn khác nhau. Ở Việt Nam, chủng AHPND gọi là KC13.17.5 được phân lập và xác định là vi khuẩn Vibrio sp..Nhưng trình tự gen 16S rRNA cho thấy rằng nó không phải là V. parahaemolyticus. Để mô tả thêm về đặc điểm của vi khuẩn, bộ gen của vi khuẩn được giải trình tự.

DNA của vi khuẩn được Sambrook và Russell chuẩn bị. Một bộ đôi được tạo ra từ DNA dùng để sử dụng chuẩn bị mẫu Illumina Nextera XT DNA với một bộ kit. Mẫu được giải trình tự bằng cách sử dụng Illumina MiSeq và MiSeq kit thuốc thử phiên bản 2 (300 chu kỳ). Dữ liệu trình tự đã được sắp xếp bởi CLC Genomics Workbench theo phiên bản 6.5.1 và sau đó được phân tích trên máy chủ Rast. BLASTn tìm gen đã được sử dụng để tìm ra các trình tự tương đồng với gen độc lực giống như plasmid và  được biết đến như giả định.

Bộ gen của các chủng đã được sắp xếp thành 42 đoạn ống. Máy chủ RAST ghi chú và xác định được 5.288 gen. Đi sâu vào đặc tính, láng giềng của V. parahaemolyticus được dự đoán là Vibrio harveyi  ATCC BAA-1116. Tìm kiếm tương đồng bằng cách sử dụng gen dự đoán cũng cho thấy sự tương đồng cao với các gen V. harveyiVibrio campbellii so với V. parahaemolyticus.

Chúng tôi tìm thấy trước đây Contig 4 của TUMSAT_D06_S3 (63 kbp) đã được lưu giữ trong số 3 chủng AHPND nhưng không được bảo toàn trong 3 chủng AHPND. Trình tự này có thể là một plasmid. Trong nghiên cứu này, một số các đoạn như đoạn 21 (29 kbp) và đoạn 27 (16 kbp), đã gần như giống hệt nhau đển Contig 4 TUMSAT_D06_S3. Các gen độc lực giả định đã được xác định và được sử dụng để chẩn đoán AHPND bằng PCR. Bởi vì đoạn 25 (3.8 kbp) giống với các gen độc lực, chúng tôi cho rằng dòng này đã được tạo ra độc lực bằng cách mua lại các plasmid.

Tại đây, chúng tôi nhìn nhận AHPND gây ra bởi nhóm Vibrio nhưng không phải là V. parahaemolyticus. Chủng này cũng sở hữu những gen độc tố protein và trình tự plasmid có liên quan. Sự căng thẳng nhất là với V. harveyi, có nghĩa là các gen độc tố có thể được truyền đến các loài Vibrio khác nhau. Nghiên cứu sâu hơn về cách các gen được truyền giữa các loài là cần thiết để ngăn chặn sự lây lan của AHPND.

Nghiên cứu được tài trợ bởi Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn (Bộ NN & PTNT) Việt Nam thuộc dự án "Nghiên cứu tác nhân gây AHPND ở miền Bắc Việt Nam", Tổ chức Heiwa Nakajima, Nhật Bản và được hỗ trợ bởi Cơ quan Khoa học và Công nghệ Nhật Bản/Cơ quan Hợp tác Quốc tế Nhật Bản, Khoa học và Hợp tác nghiên cứu công nghệ vì sự phát triển bền vững (JST/JICA, SATREPS).

Shrimpnews.com
Đăng ngày 24/09/2015
Lâm Nhất Phong
Dịch bệnh

Ghẹ vuông chắc thịt không thua ghẹ biển!

Nếu có dịp về Năm Căn, Ngọc Hiển, Ðầm Dơi, ngoài tôm, cua, cá, sò…. thì đừng quên thưởng thức đặc sản ghẹ vuông. Ghẹ vuông chắc thịt, ngon nên được nhiều người dân địa phương, du khách cũng như thị trường tiêu thụ ưa chuộng.

Ghẹ vuông
• 11:58 07/06/2021

Ảnh đẹp thủy sản: Món ăn mang đậm nét đồng quê Việt

Ảnh đẹp thủy sản hôm nay lại mang chúng ta đến gần hơn với những món ăn gắn liền của tuổi thơ qua các nhìn ảnh vô cùng đẹp đẽ, những món ăn mà đã gắn liền với biết bao thế hệ.

Cua đồng.
• 19:49 28/05/2021

Ảnh đẹp: Loài hoa của miền sông nước

Miền Tây không chỉ có sông nước mênh mông mà cảnh sắc lại hữu tình. Kết hợp từ những loài hoa tím hồng rực rỡ hòa quyện tạo nên màu sắc của đồng bằng. Đi đâu chúng ta cũng có thể bắt gặp dễ dàng các loài hoa ấy.

Hoa sen.
• 12:13 24/05/2021

Nhật ký về quê

Quê hương là chùm khế ngọt, dù bạn có đi xa bao lâu thì quê hương cũng luôn mở vòng tay chào đón bạn quay trở về, nếu có một ngày bản thân cảm thấy mệt mỏi ở chốn sài gòn nhộn nhịp thì hãy tạm gác mọi chuyện về quê một chuyến nhé!

Tôm càng xanh.
• 13:44 20/05/2021

Dịch bệnh TPD bùng phát trên tôm

Trong thời gian gần đây, dịch bệnh trên tôm tại các vùng nuôi trọng điểm đang diễn biến phức tạp, lan rộng nhiều khu vực với tỷ lệ thiệt hại ngày càng gia tăng. Đáng chú ý nhất là sự bùng phát mạnh của bệnh TPD (bệnh gan tụy cấp tính trên tôm), gây thiệt hại nặng nề cho người nuôi.

Tôm thẻ chân trắng
• 09:00 07/05/2025

Peptide kháng khuẩn ứng dụng trong phòng bệnh tôm

Trong nuôi tôm, so với giai đoạn năm 1991 nhiều loại kháng sinh được bà con sử dụng có khả năng chống lại nhiều loại vi khuẩn gây bệnh tôm, bằng việc hòa vào nước tạt trực tiếp xuống ao nuôi khi tôm bị bệnh hay trộn vào thức ăn cho ăn trực tiếp để phòng bệnh. Đến năm 2024 hầu hết các chủng vi khuẩn có khả năng kháng đa số các loại kháng sinh.

Kháng khuẩn tôm
• 10:29 05/05/2025

Hiệu quả của peptide kháng khuẩn (AMPs) trong phòng trị bệnh tôm

Trong ngành nuôi tôm, so với giai đoạn năm 1991, người nuôi từng sử dụng nhiều loại kháng sinh để phòng và trị bệnh.

Vi khuẩn
• 10:36 24/04/2025

Phòng chống dịch bệnh thủy sản trong mùa nắng nóng

Mùa nắng nóng đang đến gần, kéo theo nguy cơ bùng phát nhiều loại dịch bệnh trên thủy sản, đặc biệt là tôm, cá nuôi nước ngọt và nước lợ. Để đảm bảo năng suất và chất lượng, người nuôi cần chủ động áp dụng các biện pháp phòng chống dịch bệnh kịp thời và hiệu quả.

Ao tôm
• 10:02 18/04/2025

Lãi đậm, công nhàn với mô hình nuôi cá - ếch kết hợp

Tại huyện Vị Thủy, tỉnh Hậu Giang, mô hình nuôi kết hợp giữa ếch và cá đang mở ra cơ hội gia tăng thu nhập cho nhiều hộ nông dân. Nổi bật là anh Lâm Văn Hiệp, người đã mạnh dạn áp dụng mô hình này tại ấp 8, huyện Vị Thủy và đạt được hiệu quả kinh tế đáng kể.

cho ếch ăn
• 23:27 17/05/2025

Bí quyết xử lý nước bằng thuốc tím mà người nuôi cần biết

Trong nuôi trồng thủy sản, việc duy trì chất lượng nước ao và kiểm soát dịch bệnh là yếu tố quyết định đến năng suất và hiệu quả kinh tế. Một trong những giải pháp thường được áp dụng để xử lý nước và phòng ngừa mầm bệnh chính là thuốc tím, hay còn gọi là kali permanganat (KMnO₄). Với đặc tính oxy hóa mạnh, hợp chất này mang lại nhiều lợi ích thiết thực nếu được sử dụng đúng cách và đúng thời điểm.

Thuốc tím
• 23:27 17/05/2025

GlobalG.A.P: Nhãn GGN thể hiện nuôi trồng thủy sản có trách nhiệm với việc ghi nhãn chuẩn hóa, dễ hiểu

Mặc dù nhu cầu về thực phẩm có nguồn gốc bền vững ngày càng tăng, người tiêu dùng vẫn gặp khó khăn trong việc xác định nguồn gốc và phương pháp sản xuất của sản phẩm do có quá nhiều loại nhãn hàng khác nhau trên thị trường.

• 23:27 17/05/2025

Tôm bị mủ gan: Có hay không?

Trong ngành nuôi tôm, cụm từ mủ gan thường được nhắc đến khi tôm có dấu hiệu bất thường. Nhưng liệu mủ gan có thực sự là một bệnh lý riêng biệt, hay chỉ là triệu chứng của các vấn đề khác? Hiểu rõ hiện tượng này không chỉ giúp bà con nuôi tôm phát hiện sớm mà còn tìm ra cách xử lý hiệu quả, đảm bảo vụ mùa năng suất. Bài viết này sẽ làm sáng tỏ thực hư về mủ gan, từ nguyên nhân, dấu hiệu đến giải pháp xử lý.

Tôm bị bệnh
• 23:27 17/05/2025

EDTA có thể thay đổi cả vụ mùa của bạn như thế nào?

EDTA (Ethylenediaminetetraacetic acid) là một hợp chất hữu cơ có khả năng tạo phức với nhiều loại ion kim loại thông qua quá trình chelation (tạo phức chất), giúp ổn định các kim loại trong dung dịch. Với đặc tính này, EDTA đã trở thành một trong những chất phụ trợ được sử dụng rộng rãi trong nhiều ngành công nghiệp, đặc biệt là trong lĩnh vực nuôi trồng thủy sản.

Bột edta
• 23:27 17/05/2025
Some text some message..