Ông Nguyễn Hữu Dũng, Phó Chủ tịch Hiệp hội Chế biến và Xuất khẩu Thủy sản Việt Nam (VASEP), cho hay thông tư đã làm nảy sinh thêm nhiều khó khăn như thời gian kiểm nghiệm kéo dài, sản phẩm phải chờ đợi chưa được xuất nên vừa mất cơ hội, tốn thời gian, vừa mất phí lưu kho lưu bãi, thuê phương tiện bảo quản....
Cụ thể, chi phí kiểm nghiệm lô hàng thành phẩm trước khi xuất khẩu đang trở thành gánh nặng đối với DN bởi mức phí phải trả tăng trung bình 1,5-2 lần so với trước. Việc lấy mẫu kiểm nghiệm lô hàng cùng các biện pháp, thủ tục kiểm soát trước khi xuất khẩu đã khiến phần lớn lượng hàng thủy sản phải chờ đợi 7-10 ngày. Đây là một bất lợi lớn làm giảm năng lực và lợi thế cạnh tranh của DN Việt Nam.