Trong tháng 4/2016, thời tiết khá thuận lợi cho việc ra khơi, giá các mặt hàng hải sản tương đối ổn định, giá xăng dầu giảm, hiện đang là thời gian vào vụ cá Nam nên hoạt động khai thác thủy sản biển trong tháng khá sôi động. Chính sách của Chính phủ về hỗ trợ dầu và vay vốn đóng mới tàu cá tiếp tục phát huy hiệu quả, bên cạnh đó ngư dân được các ngành chức năng hỗ trợ đầu tư máy móc, ứng dụng tiến bộ khoa học kỹ thuật khai thác tiên tiến, phương pháp bảo quản cá ngay trên tàu làm tăng chất lượng và giá trị sản phẩm. Ước sản lượng khai thác thuỷ sản 4 tháng năm 2016 đạt 1.050 nghìn tấn, tăng 3% so với cùng kỳ năm 2015, trong đó khai thác biển ước đạt 1.003 nghìn tấn, tăng 3,3% so với tháng 4/2015.
Đối với nuôi cá tra, do khó khăn trên thị trường xuất khẩu khiến nhiều doanh nghiệp ép giá nguyên liệu đầu vào gây khó khăn cho người nuôi. Giá cá tra nguyên liệu tại khu vực ĐBSCL trong tháng 4/2016 tiếp tục đà tăng giá của tháng trước. Nếu như đầu tháng 3/2016, giá cá tra chỉ ở mức 19.000 đồng/kg thì sang đầu tháng 4 này đã tăng lên 23.000 đồng/kg và dự báo sẽ còn tiếp tục tăng trong thời gian tới. Tuy nhiên, từ giữa tháng 4/2016, do nhu cầu thu mua đã chững lại nên giá không còn tăng mạnh, hiện giá cá tra nguyên liệu (size 700-900 gram/con) ở mức 22.000-23.000 đồng/kg (trả chậm), tăng khoảng 500 đ/kg so với thời điểm cuối tháng 3.
Do vậy, người nuôi tiếp tục theo dõi diễn biến thị trường mà chưa vội thả nuôi, diện tích nuôi cá tra có xu hướng thu hẹp. Sản lượng thu hoạch cá tra 4 tháng đầu năm 2016 của các tỉnh ĐBSCL ước đạt 281.500 tấn, giảm 3% so với cùng kỳ. Trong đó các tỉnh sản lượng lớn lại có xu hướng giảm nhiều hơn cả như Vĩnh Long đạt 25.785 tấn (giảm 14%), Đồng Tháp đạt 90.000 tấn (giảm 5%), An Giang đạt 65.485 tấn (giảm 16%).
Đối với tôm nước lợ, điều kiện thời tiết bất lợi như hạn hán, xâm nhập mặn đã ảnh hưởng rất lớn đến các hộ nuôi tôm. Nhiều diện tích tôm bị thiệt hại do dịch bệnh bởi độ mặn quá cao. Chi cục nuôi trồng thủy sản, Trung tâm Khuyến ngư các tỉnh đang theo dõi chặt chẽ diễn biến thời tiết, độ mặn để có những khuyến cáo và kế hoạch thả giống phù hợp. Mặc dù vậy, với ưu thế khả năng chống chịu bệnh và giá bán ổn định hơn so với tôm thẻ nên tình hình nuôi tôm sú của các tỉnh ĐBSCL vẫn tăng trưởng khá. Trong 4 tháng đầu năm 2016, tôm sú thả nuôi đạt diện tích 520.342 ha (tăng 2%), sản lượng ước đạt 53.776 tấn (tăng 4%); Tôm thẻ chân trắng diện tích ước đạt 19.800 ha (giảm 8%), sản lượng ước đạt 30.604 tấn (giảm 5%).
Giá tôm sú nguyên liệu tại ĐBSCL trong tháng này đã có dấu hiệu phục hồi sau khi giảm mạnh từ 10.000-30.000 đồng/kg vào tháng trước, nguyên nhân chính khiến giá tôm tăng là do nguồn cung yếu. Tại Cà Mau, tôm sú (cỡ 20 con/kg) hiện ở mức 273.000 đ/kg, tăng 3.000 đ/kg so với thời điểm cuối tháng 3/2016; tôm (cỡ 30 con/kg) là 203.000 đồng/kg, tăng 3.000 đồng/kg và tôm (cỡ 40 con/kg) là 152.000 đồng/kg, tăng 2.000 đồng/kg so với thời điểm cuối tháng 3/2016. Giá tôm thẻ chân trắng cũng tăng nhẹ: loại cỡ 70 con/kg ở mức 131.000 đồng/kg, tăng 4.000 đồng/kg, cỡ 100 con/kg là 109.000 đồng/kg, tăng 4.000 đồng/kg.
Tuy nhiên, tại nhiều tỉnh phía Bắc, mặc dù ít bị tác động của hiện tượng hạn mặn nhưng giá thủy sản lại tăng đáng kể. Cụ thể, giá tôm rảo đã tăng lên mức 180.000-250.000 đồng/kg, tôm thẻ chân trắng đang bán với giá 250.000 đồng/kg. Tôm nước ngọt cũng có giá 250.000 đồng/kg. Đặc biệt, giá tôm sú đang bán tới 450.000 đồng/kg. Đây là mức tăng kỷ lục từ trước đến nay. Nguyên nhân là hiện nay đang là thời điểm cuối vụ, các điểm nuôi tôm ở miền Bắc đã thu hoạch gần hết nên đây chính là thời điểm khan hiếm hàng nhất.